化学经纬
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药物合成——路线设计策略和案例解析

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药物合成——路线设计策略和案例解析

本书以反合成分析法为核心,系统阐述了药物合成设计的基本规则、原理和策略。通过大量目标化合物的合成设计实例,重点介绍药物合成设计的基本步骤、主要手段和运用技巧。本书分为三大部分。第一部分概要介绍了药物合成技术的发展历程、主要任务和策略、新技术和未来发展趋势,重点对目标分子考察进行了分析。第二部分详细介绍了药物合成路线设计的基本策略,包括反合成分析策略、手性合成设计策略、选择性控制策略、合成路线的评价和选择等。并且对后期官能团化策略、计算机辅助合成路线设计和药物合成新技术等前沿领域也进行了深入阐述。第三部分为药物合成案例解析。详细介绍了70余个典型药物的合成设计实例,使读者通过这些实例的研读获得药物合成设计的感性认识与经验。


书籍目录

第1部分概论 1
第1章概论 2
1.1药物合成设计概述 3
1.1.1药物合成设计的发展史 3
1.1.2药物合成的发展趋势 6
1.1.3药物合成设计新技术 8
1.1.4药物合成设计的主要任务 10
1.1.5药物合成设计主要策略 10
1.2目标分子考察 14
1.2.1结构对称性分析 14
1.2.2重复结构的分析 16
1.2.3目标分子化学反应性 16
1.2.4类似物合成借鉴 17
1.2.5仿生合成借鉴 18
1.2.6优先转化的结构 19
1.2.7特殊的结构类型 19
参考文献 19
第2部分药物合成路线设计策略 21
第2章反合成分析法 22
2.1反合成分析的常用术语和主要手段 22
2.1.1反合成分析的常用术语 22
2.1.2反合成分析的主要手段 25
2.2一基团切断 31
2.2.1醇及其衍生物的合成设计 32
2.2.2烯烃的合成设计 36
2.2.3芳香酮的合成设计 38
2.2.4羧酸及其衍生物的合成设计 39
2.2.5饱和烃的合成设计 41
2.3二基团切断 44
2.3.1β-羟基羰基化合物的合成设计 44
2.3.2α,β-不饱和羰基化合物的合成设计 46
2.3.31,3-二羰基化合物的合成设计 50
2.3.41,5-二羰基化合物的合成设计 56
2.4非逻辑切断 60
2.4.11,2-二氧化合物的合成设计 61
2.4.21,4-二氧化合物的合成设计 76
2.4.31,6-二羰基化合物的合成设计 83
2.5杂原子化合物合成设计 87
2.5.1醚类化合物的合成设计 87
2.5.2胺类化合物的合成设计 89
2.6环状化合物的合成设计 96
2.6.1三元环的合成设计 96
2.6.2四元环的合成设计 104
2.6.3五元环的合成设计 109
2.6.4六元环的合成设计 113
2.7杂环化合物的合成设计 123
2.7.1饱和杂环的合成设计 123
2.7.2芳香杂环的合成设计 128
第3章手性合成设计 150
3.1手性合成概述 150
3.1.1手性合成常用术语 151
3.1.2手性合成设计的三大策略 153
3.2手性拆分 154
3.2.1直接结晶拆分法 154
3.2.2化学拆分法 156
3.2.3生物拆分法 157
3.2.4色谱拆分法 159
3.2.5包络拆分法 159
3.3基于“手性源”的合成设计 159
3.3.1常见的“手性源”化合物 160
3.3.2以氨基酸作为“手性源”的合成设计 161
3.3.3以有机酸作为“手性源”的合成设计 164
3.3.4以氨基醇作为“手性源”的合成设计 165
3.3.5以糖作为“手性源”的合成设计 166
3.4基于不对称合成反应的合成设计 167
3.4.1手性环氧化合物的合成设计 168
3.4.2手性1,2-二醇和手性β-氨基醇的合成设计 172
3.4.3基于不对称氢化反应和还原反应的合成设计 175
3.4.4生成不对称碳-碳键的合成设计 178
3.5不对称合成的新技术 184
3.5.1不对称串联反应 185
3.5.2不对称多组分反应 189
参考文献 194
第4章药物合成设计中的选择性控制 197
4.1选择性的定义和分类 197
4.1.1选择性的定义 197
4.1.2选择性的分类 197
4.2选择性控制方法 202
4.2.1反应底物的选择性控制 202
4.2.2反应试剂和条件的选择性控制 203
4.2.3反应位点的选择性控制 230
4.2.4官能团的选择性保护 239
参考文献 315
第5章碳氢键后期官能团化策略 320
5.1碳氢键后期官能团化的基本概念与分类 320
5.2导向性碳氢键后期官能团化 321
5.2.1导向基团诱导的碳氢键后期官能团化 321
5.2.2位阻诱导的碳氢键后期官能团化 328
5.2.3酶催化的碳氢键后期官能团化 329
5.3非导向性碳氢键后期官能团化 330
5.3.1基于自由基的非导向性碳氢键后期官能团化 330
5.3.2基于卡宾的非导向性碳氢键后期官能团化 336
5.4碳氢键后期官能团化技术在化学生物学和新药发现中的应用 338
5.4.1碳氢键后期官能团化技术在化学生物学中的应用 338
5.4.2碳氢键后期官能团化技术在新药发现中的应用 339
参考文献 341
第6章药物合成路线的评价和选择 344
6.1合成路线评价的原则和标准 344
6.2合成路线效率评价指标 345
6.2.1反应步骤和总收率 345
6.2.2原料和试剂 358
6.2.3合成操作和安全性 358
6.2.4反应安排 360
6.2.5绿色化学合成 361
参考文献 371[1] 
第7章计算机辅助合成路线设计和人工智能 372
7.1计算机辅助合成路线设计的基本组成 373
7.1.1合成路线设计的基本概念 373
7.1.2计算机辅助合成路线设计的组成部分 373
7.1.3计算机学习的作用 373
7.2计算机辅助合成路线设计的三种策略 374
7.2.1基于化学反应模板库的方法 375
7.2.2不基于化学反应模板库的方法 377
7.2.3应用针对性模板的方法 378
7.3反应产物的预测 380
7.3.1分类反应的可行性 380
7.3.2预测机制步骤 380
7.3.3反应模板排序 381
7.3.4反应产物排序 382
7.3.5产物生成 382
7.4研究进展 383
7.4.1“AI”机器人探索新反应并预测反应收率 383
7.4.2Chematica实现从路线设计到实验室验证 384
7.4.3模块化机器人系统实现化学合成的自动化 385
7.4.4高通量反应筛选平台完成反应条件优化和毫摩尔规模的制备 386
7.5展望 386
7.5.1数据的规范化 386
7.5.2数据的共享性 386
7.5.3数据的适用性 387
7.5.4评价标准 387
7.5.5接受和采用 387
7.5.6结语 387
参考文献 388
第8章合成新技术在新药发现中的应用 390
8.1多样性导向合成策略 391
8.1.1基于串联反应的多样性导向合成 392
8.1.2基于复分解关环反应的多样性导向合成 393
8.1.3基于环加成反应的多样性导向合成 394
8.1.4基于官能团配对策略的多样性导向合成 394
8.1.5基于多组分反应的多样性导向合成 395
8.2生物导向性合成策略 397
8.2.1天然产物骨架分层次策略 397
8.2.2蛋白质结构相似性聚类策略 400
8.3基于优势骨架的多样性导向合成策略 400
8.3.1基于相同优势骨架构建多样性核心骨架策略 401
8.3.2基于相同关键中间体发散性构建多样性优势多聚杂环的策略 401
8.4药物合成新技术 403
8.4.1基于高通量纳米级合成结合ASMS生物测定技术 403
8.4.2微波反应技术 404
8.4.3高压/高温反应技术 405
8.4.4微流体-微反应技术 405
8.4.5闪蒸反应技术 405
8.4.6生物催化 406
8.4.7光氧化还原化学 408
8.4.8电化学 408
8.5展望 409
参考文献 410
第3部分药物合成案例解析 415
第9章新药合成路线分析实例 416
9.1抗肿瘤药 416
9.1.1来曲唑(letrozole) 416
9.1.2阿那曲唑(anastrozole) 417
9.1.3拓扑替康(topotecan) 418
9.1.4吉非替尼(gefitinib) 419
9.1.5埃洛替尼(erlotinib) 421
9.1.6培美曲塞二钠盐(pemetrexeddisodium) 422
9.1.7尼罗替尼(nilotinib) 424
9.1.8拉帕替尼(lapatinib) 426
9.1.9Ribociclib 428
9.1.10布格替尼(brigatinib) 430
9.1.11恩西地平(enasidenib) 431
9.1.12阿可替尼(acalabrutinib) 433
9.1.13贝利司他(belinostat) 434
9.1.14Idelalisib 435
9.1.15奥希替尼(osimertinib) 437
9.1.16瑞卡帕布(rucaparib) 438
9.1.17维奈托拉(venetoclax) 440
9.2心血管系统药物 441
9.2.1氯吡格雷(clopidogrel) 441
9.2.2兰地洛尔(landiolol) 443
9.2.3考尼伐坦(conivaptan) 444
9.2.4西他塞坦(sitaxentan) 446
9.2.5雷诺嗪(ranolazine) 447
9.2.6莫扎伐普坦(mozavaptan) 448
9.2.7马西替坦(macitentan) 450
9.2.8依度沙班(edoxaban) 452
9.3抗病毒药 453
9.3.1奈韦拉平(nevirapine) 453
9.3.2磷酸奥司他韦(oseltamivirphosphate) 454
9.3.3Ombitasvir 463
9.3.4Elbsvir 465
9.4神经系统药物 467
9.4.1帕罗西汀(paroxetine) 467
9.4.2利培酮(risperidone) 468
9.4.3喹硫平(quetiapine) 470
9.4.4齐拉西酮(ziprasidone) 471
9.4.5右哌甲酯(dexmethylphenidate) 472
9.4.6艾司西酞普兰(escitalopram) 473
9.4.7度洛西汀(duloxetine) 475
9.4.8阿立哌唑(aripiprazole) 480
9.4.9普瑞巴林(pregablin) 481
9.4.10Suvorexant 482
9.4.11卡利拉嗪(cariprazine) 483
9.4.12依匹哌唑(brexpiprazole) 484
9.4.13布瓦西坦(brivaracetam) 485
9.4.14沙芬酰胺(safinamide) 486
9.5呼吸系统药物 488
9.5.1沙美特罗(salmeterol) 488
9.5.2孟鲁司特(montelukast) 489
9.5.3阿福特罗(arformoterol) 491
9.5.4芜地溴铵(umeclidinium) 493
9.5.5奥达特罗(olodaterol) 494
9.6非甾体抗炎药 495
9.6.1罗非昔布(rofecoxib) 495
9.6.2帕瑞昔布钠(parecoxibsodium) 496
9.6.3罗美昔布(lumiracoxib) 498
9.7抗过敏药 499
9.7.1西替利嗪(cetirizine) 499
9.7.2非索非那定(fexofenadine) 500
9.7.3依匹斯汀(epinastinehydrochloride) 503
9.7.4卢帕他定(rupatadine) 504
9.8抗糖尿病药 506
9.8.1罗格列酮(rosiglitazone) 506
9.8.2米格列奈(mitiglinide) 507
9.8.3阿格列汀(alogliptin) 508
9.9抗菌药 509
9.9.1环丙沙星(ciprofloxacin) 509
9.9.2左氧氟沙星(levofloxacin) 510
9.9.3莫西沙星(moxifloxacin) 514
9.9.4加雷沙星(garenoxacin) 516
9.9.5利奈唑酮(linezolid) 519
9.9.6Delafloxacin 520
9.9.7Ozenoxacin 522
9.10抗真菌药 523
9.10.1依柏康唑(eberconazole) 523
9.10.2福司氟康唑(fosfluconazole) 525
9.11其他药物 526
9.11.1索非那新(solifenacinsuccinate) 526
9.11.2咪达那新(imidafenacin) 528
9.11.3西地那非(sildenafil) 529
9.11.4霉酚酸钠(mycophenolatesodium) 530
9.11.5伐仑克林(varenicline) 532
9.11.6奈妥吡坦(netupitant) 533
9.11.7卢马卡托(lumacaftor) 535
9.11.8立他司特(lifitegrast) 536
参考文献 537
参考书目 543
索引 544



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