本次QM小课堂我们给大家介绍一种方法:利用量子力学(Quantum Mechanics)计算13C NMR数值,和实验实际测得产物的13C NMR数值的差值比较,来辅助解析分子结构问题。
利用QM-13C NMR解析小分子产物异构体
下面图一所示Chan-Lam反应的两种产物(A和B)的结构该如何确定呢?
图一. 吡唑N的Chan-Lam偶联反应的区域选择性
化学家们,你们的第一感觉是不是赶快送一个二维核磁?
备注: 绿色: Δ < 2 ppm,蓝色: 2 ≤ Δ ≤ 10 ppm,红色: Δ > 10 ppm。|Difference| 表示实验值与计算值之差的绝对值。下同。
同样,我们再来看看实验产物2的实验测定值分别和A、B异构体计算值的比较结果(表二),从数据误差结果来看,产物2的结构显然更接近异构体B。
通过简单的计算与比对的操作,问题得到完美解决。经过后面一系列的实验,结构也得到了进一步确证。
小试牛刀,初战告捷!
作为化学家的你,是不是又有了新想法——利用QM计算碳谱辅助确定产物结构的方法,是否也适用于复杂的结构?
利用QM-13C NMR鉴别天然产物结构
2010 年车永胜课题组在 Org. Lett. 杂志上报道了具有抗菌活性的Cytosporolides A-C的结构[2]。该课题组报道通过文献比对,大量的二维核磁及单晶X-衍射等复杂手段确定了Cytosporolides A的绝对构型。
随着对该系列化合物Cytosporolides的深入研究,发现其抗菌活性确实不错,于是很多课题组希望对其进行全合成。2011年,澳大利亚科学家Jonathan H. George等人对车永胜课题组报道的结构提出了质疑。他们认为车永胜课题组提出的结构中含有罕见且不稳定的九元过氧内酯环结构,相比较而言,George课题组提出的六元芳基醚结构更稳定且常见(图二中红色标识部分)。通过一系列的数据分析及化学合成工作,George课题组认为他们提出的结构更加吻合实验数据,于是对Cytosporolides系列的结构进行了修改,并发表在了 Org. Lett. 杂志上[3]。详细的结构信息如下:
来吧,让我们用数据说话!
通过对这两个课题组提出的结构比较可以看出,结构上的差别主要在图二中红色标识的部分。通过对这两个假定结构进行NMR计算,再分别与实验数据中C7-C9、C17-C23及C25部分进行比对(表三),结果显示QM计算所得的13C NMR数据,更支持George课题组所提出的修正结构。
表三. Cytosporolides A碳谱的部分实验值分别与两篇文献报道结构的QM计算碳谱值的差异(Spartan'18)
温馨小提示
参考文献:
[1] a. Warren J. Hehre (2019). Spartan’18 Tutorial and User’s Guide, Calculating NMR Spectra, page 525-529, Irvine, CA, USA: Wavefunction, Inc.b. Warren Hehre, J. Nat. Prod., 2019, 82,2299.
[3] Jonathan H. George, Org. Lett., 2011, 13, 5318.
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